23andme: что делать, когда ДНК обработали

Вы житель Беларуси, сделали 23andme Ancestry, подписали галочкой, что никогда не получите Health Report, но хотели бы увидеть что-то кроме того, что показывает сайт 23andme?

Сайт 23andme

Заполните профиль и поставьте фотку на аватарку. Распишите, как ещё с вами связаться. Попиарьте соседние сервисы, можно и эту инструкцию :)

Скачайте Raw Dump в https://you.23andme.com/tools/data/. Именно этот файл и используют все остальные сервисы.

В список родственников на этом сайте имеет смысл заглядывать примерно раз в месяц. В выборе сортировки не в первый раз стоит выбирать Newest relatives:

GEDmatch

Разных сервисов для сканирования ДНК много, 23andme самый беспроблемный для Беларуси — но люди из других стран могут пользоваться другими. Чтобы можно было искать родственников независимо от того, каким сервисом они исследовали свою ДНК, существует GEDmatch.

Сайт: gedmatch.com

Закачйте туда дамп, подождите пару часов его обработку, посмотрите список родственников с е-мейлами. До этого сайта обычно добираются самые упорные, поэтому велик шанс встретить там интересных людей :)

Можно посмотреть на разные эксперименты, например, вычислялку цвета глаз:

Если сайт не принимает дамп, потому что он на чипе v5, то его съест бета-версия на https://genesis.gedmatch.com/.

dna.land

Сервис dna.land умеет делать DNA Imputation, статистическими методами прикидывая, как выглядит ваша ДНК в тех местах, в которые 23andme не заглядывал.

Зайдите на dna.land, создайте аккаунт, закачайте ваш Raw Dump. Подождите сутки, скачайте файл Imputed VCF.

Прямо на сайте можно посмотреть другие забавные отчёты, «какой у тебя интеллект» и «будет ли у тебя близорукость-дальнозоркость», в Trait Prediction Report.

 Promethease

Развёрнутый отчёт про здоровье и генетические предрасположенности к болезням по вашей ДНК. Рисует примерно 36 тысяч пунктов, от самых интересных до тривиальных.

Зайдите на promethease.com, закачайте туда Raw Dump и Imputed VCF, который получили на dna.land. Заплатите карточкой $15 и скачайте отчёт. Чтиво на следующую неделю обеспечено :)

genomelink

На www.genomelink.io можно посмотреть ещё один няшный репорт.

opensnp.org

Весь код нужно постить на github, а свою ДНК можно запостить на opensnp.org. Время от времени на нём можно получить письма от независимых исследователей о том, что они пишут свой пейпер и по этому поводу пересчитали вашу гаплогрупу в такую-то. Там же можно ответить на вопрос, любите вы vim или emacs, чтобы выяснить, есть ли с этим генетическая корреляция.

Если хочется, можно залинковать профиль в www.openhumans.org вместе с фитнес-трекерами и чем захочется.

Вот так из простого Ancestry-сервиса 23andme делается Health и достаётся много другого интересного. Если вы нашли что-то ещё, пишите мне в telegram или facebook :)

12 thoughts on “23andme: что делать, когда ДНК обработали”

  1. Еще raw файл можно загрузить в myheritage и ftdna для поиска совпадений по их БД.

    1. Можно. v5 они, правда, не очень хорошо едят — и для v4 мне родственников в своей базе не находили, только таких же перенесённых из 23andme :(

  2. правильно ли я понял что Health Report — это программная обработка которую можно выполнить в других разных сервисах. а Ancestry — это непостредсенно расшифровка генома, которую можно потом анализировать онлайн.

    1. Ancestry — это «родословная». Когда по юридическим причинам компания не может предоставить информацию про здоровье, она может поискать родственников — и дать файлик с тем, что у них получилось рассмотреть в геноме. А уже более рисковые компании могут по этому файлику и здоровье нагадать.

  3. Познавательно! Спасибо!

    Особенно понравилось про тех, кто добирается до сайта GEDmatch, что они самые упорные))) Да, это действительно так)))

    1. Четыре поколения назад у вас с моей тётей были общие родственники :) Очень сложно находить связи по женским линиям, к сожалению :(

  4. Отличная статья! Я вот сделал частичный тест — неполный геном через Genotek в России. На выходе получил VCF-файл с приблизительно 630 тыс. SNP. Я могу из него как-то получить Raw Dump?

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

Этот сайт использует Akismet для борьбы со спамом. Узнайте, как обрабатываются ваши данные комментариев.